2000
Dibujos 1972-1999, Rupertinum Museum, Salzburg
El sonido de Paisaje, Galerie Academia, Salzburg
Renata Bender Gallery, Munich (obra sobre papel)
Galería Soledad Lorenzo, Madrid
Centro Jujol-Can Negre, Sant Joan Despí, (obra sobre papel)
El sonido de Paisaje, Galleria Anna d’Ascanio, Roma
Galeria Cyprus, Sant Feliu de Boada
Frankfurter Kunstkabinett, Frankfurt (obra sobre papel)
El sonido de Paisaje, Baukunst Gallery, Colonia
La Caja Negra, Madrid (obra gráfica)
Blanca, Sala de exposiciones Verónicas, Múrcia
Galeria Xippas, París

2001
Galería Colón XVI, Bilbao
Ramis Barquet Gallery, Nueva York
Art Bruxelles, Bruselas
Galerie Academia, Salzburg
Galeria Joan Prats y Artgràfic, Barcelona
Galerie Freihausgasse der Stadt Villach, Villach, Austria

2002
Capilla de Sant Corneli, Cardedeu
Galerie Dittmar, Berlín (obra sobre papel)
Galerie Academia, Salzburg
Caminar en l’espai, Sala de Arte Josep Bages - Torre Muntadas, El Prat de Llobregat
Centro Cultural Pelaires, Palma de Mallorca
Gallery Lutz and Thalmann, Zurich
Galeria Van der Voort, Ibiza
Micus dialógo con Hernández Pijuan, Espacio Eduard Micus, Ibiza
Obra gráfica III (1991-2002), Fundación Museo del Grabado Contemporáneo, Marbella
Baukunst Gallery, Colonia
Detrás del ciprés está la montaña, Galería Soledad Lorenzo, Madrid
Cal Talaveró, Verdú
Park Ryu Sook Gallery, Seúl, Corea del Sur

2003
Joan Hernández Pijuan. Volviendo a un lugar conocido. 1972-2002, retrospectiva en el Museo de Arte Contemporáneo de Barcelona que itinera por el Musée d’Art et d’Histoire de Neuchatel; la Kontnshalle Malmöe, Malmöe, y la Galleria Comunale d’Arte Moderna de Bolonia.
De fariones, Galeria Vértice, Oviedo (obra gráfica)
Obra gráfica III, 1991-2002, Fundación Ramiro de Maeztu, Estella, Navarra
Galleria Spirale Arte, Milán
Kaj Forsblom Gallery, Helsinki (obra sobre papel)
Gertsev Gallery, Moscú (obra gráfica)
Gallery Lutz and Thalmann, Zurich (obra sobre papel)
Hernández Pijuan. Óleos y dibujos, Fundación Duques de Soria, Centro Cultural Palacio de la Audiencia, Soria
Galería Fúcares, Almagro (obra sobre papel)
Ayuntamiento de Salàs de Pallars, Lleida, (gravados)
Galerie Renate Bender, Munich
Pintures i dibuixos 1958-2003, Acadèmia de Belles Arts, Sabadell

2004
Ramis Barquet Gallery, Nueva York
Relevos: Hernández Pijuan - Nico Manuera, Sala de exposiciones Caja Madrid, Barcelona; Salas del Jardín Botánico, Madrid; y Sala Casa Díaz Cassou, Murcia.
Grabados 2003, Galería La Caja Negra, Madrid
Xippas Galerie, París
Galerie Dittmar, Berlín
Papers, Palma XII, Vilafranca del Penedès
Galerie Rosa Turesky, Ginebra
En la piedra. Obra Gráfica 2004, Galería La Caja Negra, México
Joan Hernández Pijuan, 1993-2004, Centro Cultural Caja Granada, Puerta Real
Granada. Dibujos 2004, Carmen de la Fundación Rodríguez Acosta, Granada
Obra Gráfica, Instituto Cervantes, Moscú
Joan Hernández Pijuan. Obra sobre papel (1987-2002), Galería Rafael Pérez Hernando, Madrid

2005
Galeria Joan Prats, Barcelona
Obra sobre papel, Ramis Barquet Gallery, Nueva York
Joan Hernández Pijuan, 1993-2004 i Granada. Dibujos 2004, Fundación Ramiro de Maeztu, Estella, Navarra
Mario Mauroner Contemporary Art, Viena
Mario Mauroner Contemporary Art, Salzburg
Gallery Lutz and Thalmann, Zurich
Art Fair, Galerie Renate Bender, Frankfurt
51 Biennal de Venezia, Pavellón de Italia, Venecia
Salas Café Moderno de Caixa Galicia, Pontevedra
Kaj Forsblom Gallery, Helsinki
Ars Nova Museoon, Turku Art Museum, Finlandia
Micus meets Hernández Pijuan, Galerie Renate Bender, Munich
Premio Nacional de Arte Grafico en reconocimiento de una trayectoría, exposición en La Calcografía nacional, Madrid
Obra Gráfica, Galería Múltiple, Madrid

2006
Joan Hernández Pijuan. Graphic Work, Flowers Gallery, Londres
Mi forma de mirar, Galería Ramis Barquet, Nueva York

2007
Granada. Dibujos 2004, Instituto Cervantes, Nueva York
Proyectos para un paisaje, 1976, Galería Amaga, Avilés (gravados)
Memòria de la Segarra, Museo de Cervera, Lleida
Granada. Dibujos 2004, Instituto Cervantes, Chicago
Joan Hernández Pijuan. Dibujos 1989-2004, Galerie Dittmar, Berlín
Granada. Dibujos 2004, Instituto Cervantes, Lisboa

2008
Campos de labor. Dibujos y obra gráfica, Galería La Caja Negra, Madrid
La distancia del dibujo, exposición intinerante por Museo de Arte Abstracto Español, Cuenca; Museo de Arte Español Contemporáneo, Palma de Mallorca; y Museo de Montserrat, Barcelona.
Joan Hernández Pijuan. Art i Docència, Universidad de Barcelona, Barcelona

2009
Hommage a Joan Hernández Pijuan, Galería Andres Thalmann, Zurich

2011
Granada 1986-2005, Centro de Cultura Contemporánea, Universidad de Granada, Granada
Pictures of a Landscape, Galerie Renate Bender, Munich, Alemania
Colours of the Earth, Altana Kulturstiftung, Bad Homburg, Alemania

Paisatges, obra sobre papel, centro Can Sisteré, Barcelona

2012

A Privateregard on the Work of Joan Hernández Pijuan,  Moscow Museum of Modren Art, Moscú

Joan Hernández Pijuan. Zeichnungen 1976 bis 2001. Galerie Dittmar, Berlín

Hernández Pijuan. Galeria Palmadotze, Vilafranca del Penedés

Joan Hernández Pijuan. Obra Gráfica. Galeria Litera, Praga

joan hernández pijuan. Xippas Art Contemporain, Ginebra